شناسایی جدایه‌های اشرشیا کلی جدا شده از آب سواحل بوشهر با روش PCR
نویسندگان
چکیده مقاله:
زمینه: تشخیص با روش‌های استاندارد نتوانسته است تمام مشکلات تشخیصی اشرشیا کلی را حل نماید. اما با گسترش مطالعات ژنومیک، به نظر می‌رسد واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) توان کافی برای حل این مشکل را داشته باشد. هدف از این مطالعه تشخیص جدایه‌های محیطی اشرشیا کلی با کاربرد روش PCR و استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY بود. مواد و روش‌ها: شناسایی ملکولی اشرشیا کلی با آزمایش‌های PCR و پرایمرهای چهارگانه فوق بر روی DNA ژنومی تخلیص شده از 120 جدایه محیطی اشرشیا کلی به همراه سویه‌های استاندارد شیگلا و سویه‌های انتروهموراژیک اشرشیا کلی به عنوان کنترل انجام شد. کلیه جدایه‌های محیطی مورد استفاده در یک مطالعه قبلی از آب سواحل بوشهر جداسازی و با روش‌های استاندارد باکتری‌شناسی شناسایی شده و سپس جهت مطالعات بعدی در دمای منفی 70 نگهداری شده‌اند. یافته‌ها: پرایمرها قدرت شناسایی اهداف خود را در جدایه‌های محیطی و سویه‌های استاندارد داشتند. مشخص گردید به‌طور هم‌زمان چهار قطعه مربوط به ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY فقط در جدایه‌ها و سویه‌های اشرشیا کلی وجود دارند. این روش PCR قدرت جداسازی اشرشیا کلی را از شیگلا، به‌عنوان نزدیک‌ترین جنس فیلوژنیک، داشته و برخلاف روش‌های کلاسیک، توانست سویه انتروهموراژیک را به عنوان اشرشیا کلی تشخیص دهد. نتیجه‌گیری: روش PCR طراحی شده برای قطعات ژن‌های lacZ، uidA، cyd و lacY دقت لازم برای شناسایی و جداسازی اشرشیا کلی از گونه‌های بسیار مشابه را داشته بنابراین به‌عنوان یک روش ملکولی قابل اطمینان در تشخیص اشرشیا کلی معرفی می‌گردد.
منابع مشابه
شناسایی ژن های بتالاکتاماز در اشرشیا کلی جداشده از زخم پای دیابتی به روش Multiplex PCR در شهرستان جهرم
زخم پای دیابتی، که از عوارض دیابت شیرین است، با همراه شدن عفونت در زخم می تواند خطر قطع عضو و یا حتی مرگ را افزایش دهد. باکتری E coli ، که حضور آن در زخم پای دیابتی گزارش شده است، می تواند به وخامت وضعیت زخم منجر شود. مطالعه حاضر با هدف شناسایی ژن های بتالاکتاماز در اشرشیا کلی جداشده از زخم پای دیابتی به روش Multiplex PCR در شهرستان جهرم انجام گرفت. روش کار: تعیین حساسیت آنتی بیوتیکی اشرشیا کل...
متن کاملبررسی حذف باکتری اشرشیا کلی از آب آلوده به روش الکترولیز
Background and objective: The conventional chemical and physical methods for water disinfection include the application of ultraviolet (UV), chlorination, and ozonation. Water disinfection by electrochemical methods has been increasingly carried out recently. The goal of this applied - analytical research is to investigate the removal of E. coli bacteria, as the index of water microbial contami...
متن کاملشناسایی گونه‌های کاندیدای جدا شده از موارد ولوواژینیت کاندیدایی به روش Multiplex PCR
Normal 0 false false false EN-US X-NONE AR-SA MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal" mso-tsty...
متن کاملشناسایی گونه‌های کاندیدا جدا شده از نمونه خون بیماران مبتلا به کاندیدمی به روش Seminested PCR
زمینه و هدف: شاهد شیوع عفونت‌های قارچی از جمله کاندیدا و شیوع بیشتر بیماری ایدز، بدخیمی ها و افزایش اختلالات سیستم ایمنی هستیم. این امر زمینه را برای افزایش شیوع کاندیدیازیس سیستمیک و سپتی سمی کاندیدایی خصوصا با گونه‌های غیر آلبیکنس کاندیدا فراهم کرده است. هدف از این مطالعه تعیین هویت گونه‌های کاندیدا جدا شده از نمونه های کشت خون با استفاده از روش Seminested PCR بود. روش بررسی: 2516 نمونه ک...
متن کاملدر سویه های بالینی اشرشیا CTX-M- شیوع ژن بتالاکتاماز 15 PCR کلی توسط روش
Background and purpose: Presence of extended spectrum β -lactamase (ESBL) genes plays an important role in spreading β -lactam antibiotic resistance in the producing strains of these enzymes. The resistance of gram-negative bacteria, such as Escherichia coli, to different antimicrobial agents, has increasingly been reported. This study was conducted to determine the prevalence of ESBL in Esc...
متن کاملاثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین
Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 21 شماره 5
صفحات 383- 392
تاریخ انتشار 2018-11
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023